El Instituto de la Salud Juan Lazarte, fue creado en 1992 a través de la firma de un convenio de cooperación técnica entre la Asociación Mécia de Rosario (CESS), la Municipalidad de Rosario (Secretaría de Salud Pública), la Universidad Nacional de Rosario y la Fundación Oswaldo Cruz (Escuela Nacional de Salud Pública) de Brasil. Esta iniciativa contó con el auspicio y apoyo de la Oficina Sanitaria Panamericana de la Salud (OPS/OMS). El propósito explícito de ese acuerdo era el desarrolo de recursos humanos en Salud.

En este marco, posteriormente en el mismo año, se firma un convenio entre la Municipalidad de Rosario, la Universidad Nacional de Rosario y la Asociación Médica de Rosario para la institucionalización del Programa de Desarrollo de RRHH a nivel Municipal.

Centenares de profesionales de la salud participaron, desde entonces, de los distintos cursos, seminarios y maestrías que cuentan con la acreditación y certificación de la UNR. En el marco de ese convenio se logró la participación de numerosos y prestigiosos docentes o asesores extranjeros y del país.

De acuerdo al mencionado convenio, el 17 de octubre de 1994 se crea el Instituto de la Salud Juan Lazarte, que recibe ese nombre en homenaje al gran médico santafesino pionero en la formulación de lineamientos para el desarrollo de la Medicina Social.